در راستای هدف مندسازی وسازماندهی فعالیت های تحقیقاتی وتوسعه فناوری در حوزه های علوم بهداشتی و در راستای رسالت و اهداف دانشگاه، "پژوهشکده علوم و فناوری بهداشت" در دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی و درمانی همدان تاسیس گردید. براین اساس به منظور فعالیت های هم جهت در مراکز تحقیقاتی ارتقای سلامت، شورای دانشگاه علوم پزشکی همدان در سال 1393 با تشکیل پژوهشکده علوم و فناوری بهداشت موافقت نمود. در حال حاضر در این پژوهشکده پنج مرکز تحقیقات مصوب شامل، علوم بهداشتی، مدل سازی بیماری های غیر واگیر، عوامل اجتماعی موثر بر سلامت، بهداشت و ایمنی شغلی و سلامت تغذیه فعالیت می نمایند.