پژوهشگاه سلامت ابن سینا، در راستای تحقق اهداف وزارت متبوع، می‌کوشد با بکارگیری تمامی منابع موجود داخل و خارج از کشور و تولید دانش و ثروت و خلق فناوری‌های نوین، بومی و دانش‌بنیان، به توسعه و تسهیل پژوهش و فناوری کمک نماید. همچنین به منظور اجرای ماموریت خود، با اهمیت به ارتقاء کمی و کیفی فعالیت های پژوهشی و فناورانه و ایجاد فرهنگ تحقیق و روحیه کار جمعی، بستر مناسبی جهت ارتقاء سطح پژوهش اعضای هیئت علمی و سایر محققین را فراهم آورده و با توانمندسازی و ایجاد انگیزه لازم در آنها شرایط را به نحوی فراهم آورد که امکانات و ابزار کافی جهت تحقیق و فناوری در اختیار ذینفعان قرار بگیرد تا پژوهش‌هایی باکیفیت، کاربردی و بنیادی را مدیریت و راهبری نموده و نقش خود را در رفع مشکلات و ارتقای سلامت جامعه ایفا نماید.