عنوان طرح : شناسایی بیومارکرهایmiRNA غیرتهاجمی تشخیص بیماران مبتلا به آلزایمر و افزایش دقت تشخیص با بکار گیری شبکه عصبی مصنوعی                                          

مجری/ مجریان :  سعید افشار ، لیلی تاپاک      همکار/ همکاران : معصومه درویشی طالمی ،پریسا احقری ،علیرضا راستگوی حقی، شادی مرادی        تاریخ انتشار: اسفند 1402            

عنوان خبر: شناسایی بیومارکرهای جدید تشخیصی غیرتهاجمی در بیماران مبتلا به پارکینسون و بهبود طبقه بندی بیماری با استفاده از ماشین بردار پشتیبان

متن خبر: مقدمه : دستیابی به بینش کافی  در خصوص  مکانیسم های مولکولی بیماری آلزایمر بسیار پراهمیت است. هدف این مطالعه  استفاده از یک رویکرد زیست‌شناسی سیستمی برای شناسایی نشانگرهای زیستی تشخیصی غیر تهاجمی جدید برای این بیماری است. روش‌ها:   داده‌  بیان ژن GSE122063 و داده‌  بیان  miRNA   GSE90828 از پایگاه داده  Gene Expression Omnibus (GEO)  به دست آمد. بسته لیما تحت نرم افزار R برای ارزیابی miRNA ها و ژنهای با بیان متفاوت  مورد استفاده قرار گرفت . پس از آن شبکه تعامل پروتئین-پروتئین (PPI)  توسط نرم افزار STRING ایجاد و با نرم افزار Cytoscape ارزیابی شد. در نهایت ، شبکه عصبی پرسپترون چندلایه (MLP-NN)، به عنوان یک شبکه عصبی مصنوعی پرکاربرد  جهت طبقه بندی دو گروه مورد استفاده قرار گرفت . یافته‌ها: در مجموع 1388 ژن با بیان افتراقی در بیماران مبتلا به آلزایمر در مقایسه با گروه کنترل شناسایی شد. از سوی دیگر 11 miRNA با بیان متفاوت در بیماران مبتلا به اختلال شناختی خفیف(MCI) یافت شد.    نتایج این مطالعه نشان داد که EGFR، به عنوان یک ژن کلیدی   ، توسط miR-15b-3p و let-7a-5p مورد هدف قرار می گیرد ، در حالی که TLR4، ژن کلیدی دیگر، توسط miR-15b-3p مورد هدف قرار می گیرد . مدل  شبکه عصبی مصنوعی ساخته شده بر اساس داده های بیان     hsa-let-7a-5p و hsa-miR-15b-3p  حساسیت 857/0 و سطح زیر منحنی 917/0 در تشخیص بیماران آلزایمر را به دنبال داشت. نتیجه گیری: یافته های این مطاله  نشان می دهد که miR-15b-3p با هدف قرار دادن دو ژن کلیدی EGFR و TLR4 و let-7a5p با هدف قرار دادن EGFR می تواند نقش مهمی در پاتوژنز بیماری آلزایمر ایفا کنند. علاوه بر این، مدل شبکه عصبی  ساخته شده بر مبنای اطلاعات  بیان miR-15b-3p و let-7a-5p می تواند به عنوان یک روش تشخیصی غیر تهاجمی با حساسیت بالا برای تشخیص این بیماری به کار رود (1)

گروه مخاطب

پیام پژوهش

پژوهشگران

مدل شبکه عصبی  ساخته شده بر مبنای اطلاعات  بیان miR-15b-3p و let-7a-5p می تواند به عنوان یک روش تشخیصی غیر تهاجمی با حساسیت بالا برای تشخیص این بیماری به کار رود .

محل بکارگیری نتایج تحقیق( صنعت، جامعه)

پیشنهاد نحوه کاربست

پژوهشها و مطالعات مولکولی

ارزیابی مدل شبکه عصبی ساخته شده در نمونه های بیماران بومی